NetApp Data Fabric帮助制造商的基因测序设备

太平洋生物科学公司生产用于基因测序和生命科学的设备和系统。该公司使用NetApp Data Fabric来扩展共享存储的容量和性能。

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发表:2020年8月13日

为了跟上超出其存储预算的数据增长，Pacific Biosciences混合了NetApp的云和本地存储，以及初创公司Komprise的数据移动软件。

太平洋生物科学公司(简称PacBio)部署了NetApp Data Fabric技术，以扩大其在科学团队之间的能力和性能共享存储环境。它转而使用NetApp合作伙伴Komprise软件来简化数据迁移。

灵活的数据移动有助于PacBio动态评估其基因组测序设备的功率和性能。这家总部设在加州门洛帕克的公司，生产用于多个领域的测序仪，包括野生动物保护、改善食品供应和援助COVID-19疫苗研究。

NetApp Data Fabric使企业能够实现混合云数据管理．数据结构技术是NetApp云卷ONTAP操作系统中的一个软件组件。客户使用Data Fabric在公共云中创建一个虚拟NetApp平台，该平台反映了数据如何存储在内部。

亚当的骑士

基因组学是一门数据密集的学科，需要密集、高性能的存储。PacBio的高级IT经理Adam Knight表示，netapp和komprise的结合使他能够更好地跟上数据增长的步伐，目前的数据增长速度接近5pb，而且还在不断增长。

“我们使用NetApp Data Fabric根据需要改变性能，以支持不同的领域。我们的存储预算并没有随着数据的增长而增长。我们必须发挥创意，在一个伞下管理尽可能多的项目。如果我们有存储岛，我们就无法利用我们科学家的共同努力，”奈特说。

共同的科学努力是PacBio产品开发的关键。奈特表示，公司内部产生的很多数据都来自PacBio的工程团队，他们正在努力对设备进行产品改进。

PacBio生产长读测序仪，它允许DNA链以一种产生潜在基因变异的有效参考的方式被编译。大型机器的制造公差很紧，成本高达数十万美元。

“制造我们的仪器的目标是在更短的时间内以更低的成本支持更多的带宽和高质量的数据吞吐量。我们生成一个大量的新数据每年，”奈特说。

PacBio在NetApp FAS混合系统上标准化了其存储环境，使用NetApp e系列阵列作为多拍字节存档。通过使用预定义的用户策略，Komprise透明地在NetApp存储之间移动数据，在主FAS阵列上保持活动数据。

此外，这家基因组设备制造商还添加了NetApp StorageGrid Webscale软件定义对象存储简化元数据的标记和搜索。